Объясните, пожалуйста.

В данный момент учусь в университете, есть отсрочка до 2015 года. 
Проходил какую-то комиссию в 16 лет вместе с классом еще в школе, там дали приписное, а в нем - "годен с незначительными ограничениями". 
Затем проходил еще одну медкомиссию, когда сдавал на 1 курсе отсрочку саму ВУЗовскую. Не помню зачем я ходил по врачам в военкомате, но кажется так делали все. ЧТО ЭТО Я ПРОХОДИЛ И НЕ НАДЕЛАЛ ЛИ Я ПЛОХИХ ДЕЛОВ?
Ведь я просто быстро и мимолетно прошелся по всем врачам, насобирал галочек, поотвечал на вопросы о здоровье и ушел, собственно, отдав листочек с отсрочкой в конце. Мне выдали книжечку похожую на приписное, которую я кажется уже и потерял вовсе (( что это был за документ?
Самое главное(!), собственно -  я по причине работы собираюсь вот уже через год улетать в штаты, бросая учебу. Соответственно, во время прибывания заграницей, меня в университете уже отчислят, а значит и отсрочка - улетучится. 
И тут вдруг мне приспичит обратно в Россию, например в 2017 далеком (если от противного рассуждать). 
Какие проблемы с военкоматом меня ждут по прибытию? 
В настоящее время, кстати, уже сейчас насчитал 3 болезни категории "В", например. Может быть есть смысл уже сейчас отчисляться и получать военник, спокойно покидая страну? 

Или можно также получать отсрочки от армии, если я улетаю в штаты более чем на полгода?

Здравствуйте!

Затем проходил еще одну медкомиссию, когда сдавал на 1 курсе отсрочку саму ВУЗовскую. Не помню зачем я ходил по врачам в военкомате, но кажется так делали все. ЧТО ЭТО Я ПРОХОДИЛ И НЕ НАДЕЛАЛ ЛИ Я ПЛОХИХ ДЕЛОВ?

Это нормально. Перед вынесением решения о предоставлении отсрочки от призыва в отношении призывника должны провести медкомиссию с целью определения его категории годности. Таков порядок.

Мне выдали книжечку похожую на приписное, которую я кажется уже и потерял вовсе (( что это был за документ?

В данном случае установить что именно Вам было вручено не представляется возможным.
Единственное, что Вам могли вручить после оформления отсрочки - это копию решения призывной комиссии.

Соответственно, во время прибывания заграницей, меня в университете уже отчислят, а значит и отсрочка - улетучится.

Совершенно верно.

И тут вдруг мне приспичит обратно в Россию, например в 2017 далеком (если от противного рассуждать). 
Какие проблемы с военкоматом меня ждут по прибытию?

Согласно статье 10 ФЗ "О воинской обязанности и военной службе", граждане должны сниматься с воинского учета при выезде за границу на срок более 6 месяцев, а также вставать на воинский учет по прибытию. Нарушение обязанностей воинского учета наказывается административным штрафом в размере до 500 рублей (в соответствии со статьей 21.5 КоАП РФ).

Если по прибытию в РФ Вам еще не исполнится 27 лет, то будете подлежать призыву на общих основаниях.

В настоящее время, кстати, уже сейчас насчитал 3 болезни категории "В", например. Может быть есть смысл уже сейчас отчисляться и получать военник, спокойно покидая страну?

Процесс оформления военного билета - это достаточно длительная процедура, может занять более 3 месяцев. Поэтому решать Вам. Если у Вас на руках имеется загранпаспорт, есть медицинские основания для освобождения от призыва, то можете начать процедуру освобождения от призыва и оформления военного билета - время у Вас есть.

Или можно также получать отсрочки от армии, если я улетаю в штаты более чем на полгода?

Отсрочка от призыва по вылету за границу законом не предусмотрена.