Если по итогам медицинского лечения Ваше состояние здоровья полностью прийдет в норму, то никаких препятствий для поступления на военную службу не будет.
Другое дело, что операцию следует делать только в крайнем случае, и она не всегда дает долгосрочный положительный результат.