С язвой желудка подлежите освобождению от призыва по статье 58 Расписания болезней.
Если Вы ее вылечите, а рубец останется, то и в этом случае подлежите освобождению от призыва, цитирую 58 статью:
В фазе ремиссии заболевания достоверным признаком перенесенной язвы луковицы двенадцатиперстной кишки является наличие постязвенного рубца при фиброгастроскопии и (или) грубой рубцовой деформации луковицы, выявляемой при дуоденографии в условиях искусственной гипотонии, а перенесенной язвы желудка - наличие постязвенного рубца при фиброгастроскопии.
Призыву будете подлежать, если не останется и рубца.